MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia phenoliruptrix BR3459a chromosome 1

Total Repeats: 92528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018695	CGGC	2	8	57	64	0 %	0 %	50 %	50 %	407711773
2	NC_018695	CG	3	6	84	89	0 %	0 %	50 %	50 %	407711773
3	NC_018695	AGC	2	6	101	106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711773
4	NC_018695	GCG	3	9	138	146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711773
5	NC_018695	GCA	3	9	192	200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711773
6	NC_018695	CCG	2	6	209	214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711773
7	NC_018695	CG	3	6	220	225	0 %	0 %	50 %	50 %	407711773
8	NC_018695	CG	4	8	277	284	0 %	0 %	50 %	50 %	407711773
9	NC_018695	CTT	2	6	292	297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711773
10	NC_018695	CGAGGC	2	12	306	317	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407711773
11	NC_018695	GC	3	6	316	321	0 %	0 %	50 %	50 %	407711773
12	NC_018695	GCCG	2	8	336	343	0 %	0 %	50 %	50 %	407711773
13	NC_018695	ACG	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711773
14	NC_018695	GCG	2	6	364	369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711773
15	NC_018695	GGC	2	6	436	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711773
16	NC_018695	GCG	2	6	471	476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711773
17	NC_018695	TTCCGC	2	12	487	498	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407711773
18	NC_018695	TGT	2	6	528	533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407711773
19	NC_018695	TGA	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407711774
20	NC_018695	CAG	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711774
21	NC_018695	ACGTG	2	10	1179	1188	20 %	20 %	40 %	20 %	407711774
22	NC_018695	CGC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711774
23	NC_018695	GCG	2	6	1244	1249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711774
24	NC_018695	GC	4	8	1372	1379	0 %	0 %	50 %	50 %	407711774
25	NC_018695	GCG	2	6	1388	1393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711774
26	NC_018695	GC	4	8	1403	1410	0 %	0 %	50 %	50 %	407711774
27	NC_018695	TTC	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711774
28	NC_018695	GGC	2	6	1430	1435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711774
29	NC_018695	GCC	2	6	1475	1480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711774
30	NC_018695	GGC	2	6	1495	1500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711774
31	NC_018695	CG	3	6	1507	1512	0 %	0 %	50 %	50 %	407711774
32	NC_018695	GCC	2	6	1538	1543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711774
33	NC_018695	GGC	2	6	1555	1560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711774
34	NC_018695	CGC	2	6	1594	1599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711774
35	NC_018695	CGACCT	2	12	1600	1611	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407711774
36	NC_018695	CGAA	2	8	1626	1633	50 %	0 %	25 %	25 %	407711774
37	NC_018695	CGG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711774
38	NC_018695	CGC	2	6	1646	1651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711774
39	NC_018695	CG	4	8	1777	1784	0 %	0 %	50 %	50 %	407711774
40	NC_018695	GGC	2	6	1844	1849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711774
41	NC_018695	GGCG	2	8	1909	1916	0 %	0 %	75 %	25 %	407711774
42	NC_018695	CG	3	6	1915	1920	0 %	0 %	50 %	50 %	407711774
43	NC_018695	CGT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711774
44	NC_018695	CGA	2	6	1987	1992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711774
45	NC_018695	CTA	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407711774
46	NC_018695	CTG	3	9	2021	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711774
47	NC_018695	CGA	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711774
48	NC_018695	CGCA	2	8	2063	2070	25 %	0 %	25 %	50 %	407711774
49	NC_018695	TTC	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711774
50	NC_018695	TCG	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711774
51	NC_018695	TCA	3	9	2121	2129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407711774
52	NC_018695	CGA	2	6	2164	2169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711774
53	NC_018695	GCC	2	6	2215	2220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711774
54	NC_018695	TCG	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711774
55	NC_018695	GC	3	6	2343	2348	0 %	0 %	50 %	50 %	407711774
56	NC_018695	AAG	2	6	2409	2414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711774
57	NC_018695	CTG	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711774
58	NC_018695	AGA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711774
59	NC_018695	GAA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711774
60	NC_018695	CGG	2	6	2617	2622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711774
61	NC_018695	CAC	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407711774
62	NC_018695	TGC	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711774
63	NC_018695	CGA	2	6	2665	2670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711774
64	NC_018695	CCT	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407711775
65	NC_018695	TCG	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711775
66	NC_018695	CGC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711775
67	NC_018695	CAC	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407711775
68	NC_018695	GC	3	6	3129	3134	0 %	0 %	50 %	50 %	407711775
69	NC_018695	GCG	2	6	3149	3154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711775
70	NC_018695	CTC	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407711775
71	NC_018695	GC	3	6	3201	3206	0 %	0 %	50 %	50 %	407711775
72	NC_018695	TCACGC	2	12	3224	3235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407711775
73	NC_018695	CGC	2	6	3294	3299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711775
74	NC_018695	GCT	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711775
75	NC_018695	CAG	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711775
76	NC_018695	CTA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407711775
77	NC_018695	TGC	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711775
78	NC_018695	TGG	3	9	3443	3451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407711775
79	NC_018695	TCG	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711775
80	NC_018695	GTTC	2	8	3521	3528	0 %	50 %	25 %	25 %	407711775
81	NC_018695	GC	3	6	3529	3534	0 %	0 %	50 %	50 %	407711775
82	NC_018695	CGA	2	6	3594	3599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711775
83	NC_018695	TGG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407711775
84	NC_018695	GAA	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711775
85	NC_018695	GC	3	6	3768	3773	0 %	0 %	50 %	50 %	407711775
86	NC_018695	GAA	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711775
87	NC_018695	ACG	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711775
88	NC_018695	TGC	2	6	3968	3973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711775
89	NC_018695	GC	3	6	4001	4006	0 %	0 %	50 %	50 %	407711775
90	NC_018695	ACG	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711775
91	NC_018695	GTG	2	6	4042	4047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407711775
92	NC_018695	A	6	6	4170	4175	100 %	0 %	0 %	0 %	407711776
93	NC_018695	ACA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407711776
94	NC_018695	CAC	2	6	4311	4316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407711776
95	NC_018695	TCGA	2	8	4341	4348	25 %	25 %	25 %	25 %	407711776
96	NC_018695	CTCCAT	2	12	4403	4414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407711776
97	NC_018695	GAC	2	6	4455	4460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
98	NC_018695	AGCGC	2	10	4474	4483	20 %	0 %	40 %	40 %	407711776
99	NC_018695	TGA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407711776
100	NC_018695	CGG	2	6	4514	4519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711776
101	NC_018695	GGC	2	6	4551	4556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711776
102	NC_018695	CGTG	2	8	4576	4583	0 %	25 %	50 %	25 %	407711776
103	NC_018695	AAG	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711776
104	NC_018695	GAA	2	6	4680	4685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711776
105	NC_018695	TGA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407711776
106	NC_018695	CGA	2	6	4763	4768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
107	NC_018695	GAA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711776
108	NC_018695	TCG	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
109	NC_018695	GCG	2	6	4906	4911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711776
110	NC_018695	CAA	2	6	4934	4939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407711776
111	NC_018695	TGC	2	6	4951	4956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
112	NC_018695	GGCGTG	2	12	4992	5003	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	407711776
113	NC_018695	GTGCT	2	10	5043	5052	0 %	40 %	40 %	20 %	407711776
114	NC_018695	CGG	2	6	5078	5083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711776
115	NC_018695	GC	3	6	5102	5107	0 %	0 %	50 %	50 %	407711776
116	NC_018695	CG	3	6	5116	5121	0 %	0 %	50 %	50 %	407711776
117	NC_018695	GAA	2	6	5156	5161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711776
118	NC_018695	CGA	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
119	NC_018695	CGTG	2	8	5206	5213	0 %	25 %	50 %	25 %	407711776
120	NC_018695	GTC	2	6	5270	5275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
121	NC_018695	GC	4	8	5282	5289	0 %	0 %	50 %	50 %	407711776
122	NC_018695	GAA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711776
123	NC_018695	GAA	2	6	5319	5324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711776
124	NC_018695	ACG	2	6	5344	5349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
125	NC_018695	GCA	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
126	NC_018695	TCG	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
127	NC_018695	GC	6	12	5382	5393	0 %	0 %	50 %	50 %	407711776
128	NC_018695	TCG	2	6	5512	5517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
129	NC_018695	GGC	2	6	5532	5537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711776
130	NC_018695	GCT	2	6	5627	5632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
131	NC_018695	TCG	2	6	5634	5639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
132	NC_018695	CAT	4	12	5723	5734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407711776
133	NC_018695	GC	3	6	5755	5760	0 %	0 %	50 %	50 %	407711776
134	NC_018695	GCT	2	6	5771	5776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
135	NC_018695	TTC	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711776
136	NC_018695	GAT	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407711776
137	NC_018695	CTACAT	2	12	5822	5833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407711776
138	NC_018695	GCC	2	6	5840	5845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711776
139	NC_018695	TGC	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
140	NC_018695	CG	3	6	6000	6005	0 %	0 %	50 %	50 %	407711776
141	NC_018695	CTG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711776
142	NC_018695	GGT	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407711776
143	NC_018695	ACG	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
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145	NC_018695	CGAT	2	8	6088	6095	25 %	25 %	25 %	25 %	407711776
146	NC_018695	CGAG	2	8	6100	6107	25 %	0 %	50 %	25 %	407711776
147	NC_018695	GCG	2	6	6108	6113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711776
148	NC_018695	GAAGC	2	10	6138	6147	40 %	0 %	40 %	20 %	407711776
149	NC_018695	GTGACC	2	12	6174	6185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407711776
150	NC_018695	GC	3	6	6228	6233	0 %	0 %	50 %	50 %	407711776
151	NC_018695	CGA	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
152	NC_018695	CAG	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
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154	NC_018695	AGC	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
155	NC_018695	AGC	2	6	6478	6483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
156	NC_018695	ACG	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
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159	NC_018695	ACG	2	6	6567	6572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711776
160	NC_018695	GAT	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407711776
161	NC_018695	CGG	2	6	6597	6602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711776
162	NC_018695	GC	3	6	8530	8535	0 %	0 %	50 %	50 %	407711777
163	NC_018695	TCA	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407711777
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165	NC_018695	TTG	2	6	8668	8673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407711777
166	NC_018695	GACT	2	8	8838	8845	25 %	25 %	25 %	25 %	407711777
167	NC_018695	CGGA	2	8	8897	8904	25 %	0 %	50 %	25 %	407711777
168	NC_018695	CG	3	6	8967	8972	0 %	0 %	50 %	50 %	407711777
169	NC_018695	CGG	2	6	9008	9013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711777
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247	NC_018695	GCCG	2	8	13448	13455	0 %	0 %	50 %	50 %	407711779
248	NC_018695	GAA	2	6	13499	13504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711779
249	NC_018695	TGGC	2	8	13540	13547	0 %	25 %	50 %	25 %	407711779
250	NC_018695	TGC	2	6	13549	13554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711779
251	NC_018695	CAC	2	6	13649	13654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407711779
252	NC_018695	GC	3	6	13707	13712	0 %	0 %	50 %	50 %	407711779
253	NC_018695	G	6	6	13894	13899	0 %	0 %	100 %	0 %	407711779
254	NC_018695	GC	3	6	13922	13927	0 %	0 %	50 %	50 %	407711779
255	NC_018695	TTC	2	6	13960	13965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711779
256	NC_018695	TGC	2	6	14108	14113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711779
257	NC_018695	GCG	2	6	14130	14135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711779
258	NC_018695	AGG	2	6	14180	14185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407711779
259	NC_018695	CCT	2	6	14329	14334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407711779
260	NC_018695	TTGCC	2	10	14369	14378	0 %	40 %	20 %	40 %	407711779
261	NC_018695	ATC	2	6	14430	14435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407711779
262	NC_018695	GAA	2	6	14453	14458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407711779
263	NC_018695	CTT	2	6	14492	14497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711779
264	NC_018695	GCG	2	6	14505	14510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711779
265	NC_018695	CGA	2	6	14528	14533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711779
266	NC_018695	CGT	2	6	14661	14666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711780
267	NC_018695	CTT	2	6	14732	14737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711780
268	NC_018695	CTT	2	6	14758	14763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711780
269	NC_018695	GTGCT	2	10	14905	14914	0 %	40 %	40 %	20 %	407711780
270	NC_018695	CTG	2	6	14935	14940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711780
271	NC_018695	CGG	2	6	15024	15029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711780
272	NC_018695	GC	3	6	15101	15106	0 %	0 %	50 %	50 %	407711780
273	NC_018695	GCT	2	6	15119	15124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711780
274	NC_018695	GAC	2	6	15133	15138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711780
275	NC_018695	GC	3	6	15330	15335	0 %	0 %	50 %	50 %	407711780
276	NC_018695	CTG	2	6	15430	15435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711780
277	NC_018695	CCGA	2	8	15484	15491	25 %	0 %	25 %	50 %	407711780
278	NC_018695	GCC	2	6	15499	15504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407711780
279	NC_018695	TGGTG	2	10	16508	16517	0 %	40 %	60 %	0 %	407711781
280	NC_018695	TCG	2	6	16528	16533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711781
281	NC_018695	CAT	2	6	16607	16612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407711781
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283	NC_018695	CTCA	2	8	16733	16740	25 %	25 %	0 %	50 %	407711781
284	NC_018695	GGT	2	6	17247	17252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407711782
285	NC_018695	CTG	2	6	17262	17267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711782
286	NC_018695	TTC	2	6	17410	17415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407711782
287	NC_018695	GAC	2	6	17485	17490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711782
288	NC_018695	TCG	2	6	17504	17509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711782
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290	NC_018695	CG	3	6	17666	17671	0 %	0 %	50 %	50 %	407711782
291	NC_018695	CCCT	2	8	17674	17681	0 %	25 %	0 %	75 %	407711782
292	NC_018695	CTG	2	6	17713	17718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711782
293	NC_018695	GGC	2	6	17725	17730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711782
294	NC_018695	T	6	6	17750	17755	0 %	100 %	0 %	0 %	407711782
295	NC_018695	T	7	7	17777	17783	0 %	100 %	0 %	0 %	407711782
296	NC_018695	GGA	2	6	17838	17843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407711782
297	NC_018695	GCA	2	6	17851	17856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407711782
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299	NC_018695	GACG	2	8	18234	18241	25 %	0 %	50 %	25 %	407711783
300	NC_018695	ACC	2	6	18258	18263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407711783
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303	NC_018695	CGT	2	6	18496	18501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407711783
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384	NC_018695	TCGA	2	8	23534	23541	25 %	25 %	25 %	25 %	407711789
385	NC_018695	CGG	2	6	23545	23550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407711789
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387	NC_018695	CCA	2	6	23622	23627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407711789
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